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Horizon Discovery

Horizo​​n Discovery 於2007年創建,利用基因編輯平台 rAAV、Zinc Finger Nucleases (ZFNs) 及 CRISPR 能夠改變幾乎任何人類或哺乳動物細胞系的內源基因序列,高精度和靈活的量身訂制基因編輯細胞株。其現在提供超過 23,000 種目錄產品,幾乎所有產品都基於基因編輯的應用來生成細胞株,從而精確模擬基因疾病中發現的致病突變。

Dharmacon 成立於1995年,現隸屬於 Horizon Discovery 的一員。提供高品質的 RNAi 系列商品 (包含 siRNA、shRNA、miRNA 與客製化 RNA 服務),以及各物種之 cDNA 與 ORF 等相關商品。更推出眾多物種適用的 CRISPR 產品,其高專一性與效率是基因編輯的首選。

Open Biosystems 成立於2001年,與 Dharmacon 產品線合併後,共同隸屬於Horizon Discovery 的一員。提供 Vector-based 的相關產品線,包含各物種之 cDNA、ORF 與 shRNA產品,應用於各式基因調控,如短暫性、長期性、誘導型、RNAi 或 大量表現,提供了強大的工具來研究基因功能。

  • 產品系列
  • 基因編輯
  • 基因調控
  • 篩選平台
產品系列

基因編輯 (CRISPR)

Dharmacon Edit-R CRISPR-Cas9 基因編輯平台擁有 Broad Institute 的專利執照,極大地簡化了剔除基因的操作流程,精確並永久地改變內源基因表達的能力。

CRISPR 基因編輯有兩個必需的組件 - 分別是Guide RNA 和 Cas9 核酸酶;每一個都有多種產品型式,取決於需求的細胞類型和應用。包括DNA-free 與 Vector-based Lentivirus 等系統化產品選擇。

 

Ready-Made Cell Model

利用 CRISPR 進行基因編輯,專一且精確地對目標基因進行編輯,提供快速、省時與便利的細胞株產品,產品包含如下:

  • Knockout models with the HAP1 cell line (亦包括 Single KO / Double KOs / Triple KOs)
  • Point mutations in cancer-relevant cell models (包含 DLD1 / MCF10 / HCT116 的細胞類型)
  • Knock-in reporter cell models (tGFP / NanoLuc / HaloTag)

基因調控

Dharmacon 基因調控分為:Knockdown 與 Oeverexpression。其設計結合科學創新與專一性新型修飾策略,優化了產品效價,有效抑制基因表現與大量表現目標基因。產品涵蓋了短暫性、長期性,誘導型和 in vivo 實驗最完整應用組合。

Knockdown 產品包含:siRNA、microRNA、microRNA-adapted shRNA 及 客製化 RNA 合成。

Overexpression 產品包含:cDNAs 及 ORFs。




客製化合成

簡易!方便!完全客製化!建立您所需的客製化 RNAi 產品或篩選平台,滿足您獨特的實驗需求。

Dharmacon 可客製並設計您所需的各式 DNA 與 RNA,其客製化產品種類如下:

(1) Custom siRNA / microRNA:可客製化修飾或未修飾的 siRNA / microRNA,如 ON-TARGET、ON-TARGETplus、siSTABLE 、Accell 專利修飾 或各種官能基或螢光修飾。

(2) Custom Single-Strand RNA / DNA:利用專業的2'-ACE 化學合成法,RNA 最長可穩定合成至 105 mer;DNA 最長可以至 150 mer。

(3) Custom CRISPR crRNA / sgRNA:隨時更新的 crRNA設計軟體,確保有最佳的專一性與功能性。可合成短片段的 crRNA 及具有全長的 sgRNA。

(4) Cherry-Pick Library:產品以 96- 或 384-well 的型式,可直接納入 RNAi 、cDNA/ORF clone、CRISPR Edit-R 等等多樣產品,建立您量身打造的篩選 Library。


References Standards

人類基因組 Reference Standards 的領先提供商,包括 Sanger sequencing,NGS,qPCR,FISH,IHC,cfDNA,RNA Assays Supported 的標準品及切片,產品涵蓋超過 80 種癌基因特異性突變。 這些標準為實驗室提供可持續的參考資料來源,提供前所未有的控制水平,亦可定期監測工作流程與化驗標準是否符合規定。


BioProductions (CHO GS KO cells)

以 GS null CHO SOURCE 生物製造平台為基礎,確保為各種規模的公司提供尖端的 CHO 細胞,如重組蛋白與抗體生產。提供的產品和服務旨在革新大分子療法的生產,提高任何公司生產其生物製劑管道的能力。


Cell-based Screening Service

從諮詢到交付均與您合作-提供功能基因組和細胞組篩選服務。服務包含如下:

  • Immuno-Oncology Platform
  • Functional Genomic Screening
  • Drug Combination Screening
  • In Vitro Assay Services
  • In Vivo Assay Services
基因編輯

Cas9 Nuclease

Cas9 核酸酶是一種由小片段 RNA 引導的核酸內切酶,進行基因組 DNA 靶標識別和切割。Dharmacon 所有的 Cas9 核酸酶產品都是由Streptococcus pyogenes Type II Cas9 核酸酶優化而來。

產品選擇包含兩種系統:

(1) DNA-free 系統:沒有外源性 DNA 存在,確保 Cas9 的短暫性表現狀況,並不會產生不可預期的嵌入性突變 (Insertional Mutagenesis)。產品包含:Cas9 Nuclease mRNA 及 Cas9 Nuclease Protein NLS

(2) Vector-based 系統:可利用 Transfection 或病毒 Infection 的方式使 Cas9 運送進入目標細胞表現,實行基因編輯。產品包含:Cas9 Nuclease Expression Reagents (含螢光或抗生素篩選) 及 Lentiviral Cas9 Nuclease Reagents (同樣含螢光或抗生素篩選,並可包裏成病毒,進行細胞 Infection)


Guide RNA

Guide RNA 協助 Cas9 核酸酶在特定的基因組位置進行切割。 有效的 Guide RNA 的設計對於實現有效的基因敲除 (Knockout) 至關重要。所有Edit-R 預先設計的 Guide RNA 產品均採用經過驗證的算法進行設計,通過評估成千上萬個設計的研究報告並更新設計軟體,這些位點可實現高特異性的功能敲除,以最大程度地發揮功能性敲除的可能性,而不僅僅是產生雙鏈斷裂。

產品選擇包含兩種系統:

(1) DNA-free 系統:沒有外源性 DNA 存在,確保不會產生不可預期的嵌入性突變 (Insertional Mutagenesis)。產品包含:Synthetic crRNA、Synthetic tracrRNA 及 Synthetic sgRNA

(2) Vector-based 系統:可利用 Transfection 或病毒 Infection 的方式使 Guide RNA 運送進入目標細胞表現,實行基因編輯。產品包含:Lentiviral sgRNA (僅表現 sgRNA) 及 All-in-one Lentiviral sgRNA (在一個 Vector 中,可同時表現 Cas9 及 Guide RNA)


CRISPR Activation (CRISPRa)

CRISPR Activation (CRISPRa) 提供了一套簡單有效的工具,可以通過在自然環境中大量表現目標基因來研究其功能。 該系統需要兩個組件進行操作:Guide RNA 和 失去活性的 dCas9 (只會進行DNA binding而不具核酸酶切割活性的 dead mutation, dCas9)

產品選擇包含兩種系統:

(1) DNA-free 系統:產品包含 Synthetic CRISPRa crRNA、Synthetic CRISPRa SAM tracrRNA 及 dCas9-VPR mRNA

(2) Vector-based 系統:產品包含 Lentiviral CRISPRa sgRNAs 及 dCas9-VPR Plasmids/Lentiviral Particles


Custom CRISPR Design

透過討論與諮詢,建立您所需的 CRISPR 基因編輯系統,滿足您獨特的實驗需求。有任何需要歡迎聯繫當區業務。

基因調控

siRNA

Dharmacon siRNA Knockdown 實驗是短暫性評估基因功能的最受歡迎產品系列。利用了SMARTpool Technology 有效減少脫靶(Off-target) 以獲得更好的特異性 (On-Target)。

Dharmacon siRNA 產品保證基因表達沉默至少 75% 以上。所有產品型式皆包含SMARTpool、Set of 4 及 Individual siRNA,產品種類如下:

(1) 經濟型 siGENOME siRNA:具單股修飾,適用於所有人類,小鼠和大鼠基因的高效 siRNA。

(2) 專業型 ON-TARGETplus siRNA:具專利雙股修飾,強化基因沉默功能,並將脫靶效應降低高達90%以上。 ON-TARGETplus可以確保功能性降低和最佳特異性。

(3) 超級型 Accell siRNA:無需轉染試劑即可將 siRNA 運送至難轉染的細胞中,Accell siRNA 成功應用在神經元、免疫和幹細胞中的非病毒 RNAi 產生。

(4) 非轉譯型 Lincode siRNA:可有效使 Long non-coding RNA (lncRNA)基因沉默,同時其上具有修飾以確保特異性。


microRNA

microRNA 是 小片段 non-coding RNA,且每個 microRNA 都可能調節數百個基因。其機制為通過 RISC 的參與與目標基因 3'UTR 中互補序列的結合,從而導致 mRNA 不穩定和轉譯減弱。

Dharmacon microRNA 產品種類包含如下:

(1) miRIDIAN microRNA mimics:人工合成的內生性microRNA ,以研究其大量表現 (Gain-of-function) 的影響

(2) miRIDIAN microRNA Hairpin Inhibitors:可抑制內生性micrRNA 活性,以研究功能喪失 (Loss-of-function) 的影響

(3) shMIMIC Lentivial microRNA:可表達 microRNA 的慢病毒載體,具有多個 Promoters 和 Reporter 基因可供選擇

(4) shMIMIC Inducible Lentivial microRNA:結合最新一代強大的 Tet-ON 誘導技術,誘導 microRNA 表現。為業界最具創新性的成熟 microRNA 表達系統


microRNA-Adapted shRNA

short hairpin RNA (shRNA) 可通過 Plasmid Transfection 或慢病毒 Infection 進入細胞。可以在宿主基因組中以創建表現穩定的細胞株。另外,可以應用在難以轉染的 Primary cells 中,並應用於 in vivo 實驗。Dharmacon 利用 microRNA 的相似結構,設計出 microRNA-adapted shRNA。並結合 RNA Polll Promoter (Pol ll) 進行轉錄,可避免過量表現而產生毒性。研究表明,使用 microRNA-adapted shRNA,可以促進更有效的基因沉默效果並降低 RNAi 的毒性。

Dharmacon microRNA-Adapted shRNA 產品種類包含如下:

(1) GIPZ Lentiviral shRNA:涵蓋基因最廣,實現高效 shRNA 基因沉默

(2) TRIPZ Inducible Lentiviral shRNA:專業誘導型 shRNA 表達,可於正確時間點表達 shRNA

(3) SMARTvector Lentiviral shRNA:先進的 shRNA 設計以及多個 Promoters 和 Reporter 基因可供選擇,以確保基因沉默

(4) SMARTvector Inducible Lentiviral shRNA:shRNA 結合SMARTvector 與 Tet-ON 誘導技術的所有優勢,可實現對基因沉默的空前控制


cDNAs and ORFs

Mammalian Gene Collection (MGC) 於 2009 年由美國 NIH 完成,現已被確認為全長 cDNA 序列的黃金標準。Dharmacon 除了提供哺乳動物 (如人類、老鼠、大鼠與牛)的 cDNA/ORF clone 外,另外亦提供非哺乳動物 (如酵母菌、線蟲、斑馬魚、牛蛙及大腸桿菌)的 Knockout strains, Promoter collections 等等多樣產品。

Dharmacon cDNAs 及 ORFs產品種類包含如下:

(1) MGC cDNA clones:從 Mammalian Gene Collection 計畫所收集的 Human、Mouse、Rat 以及 Bovine cDNAs clones

(2) ORF clones:可直接用於細胞中表現的 clones。依其系統可分為,Gateway 或 Expression-ready ORF 的表達系統

(3) Non-mammalian cDNAs & ORFs:物種包含Yeast、C. elegans、E. coli、D. rerio 或者 X. laevis。

篩選平台

Immuno-Oncology Platform

免疫腫瘤學是一個科學研究領域,研究身體自身免疫系統如何對抗癌症,有效辨認癌細胞而不傷害正常細胞。包含的服務如下:

  • ADCC / CDC Assays
  • T-Cell Mediated Tumor Cell Lysis Assay
  • Mixed Lymphocyte Reaction
  • T-Cell Activation Assay
  • Treg Suppression Assay
  • MDSC Supression Assay

Functional Genomic Screening

利用 siRNA 和 CRISPR-Cas9 篩選平台建立了功能基因組篩選的核心專業知識。使用這些篩選技術,我們可以幫助您找到並驗證新的藥物目標,確定耐藥性或敏感性的機制,並確定合成致死率。包含的服務如下:

  • siRNA Screening
  • CRISPR-Cas9 Screening
    • CRISPR Knockout Screening
    • CRISPRa Screening
    • CRISPRi Screening
    • Dual CRISPR Screening
    • Pooled Phenotypic CRISPR Screening
    • Arrayed CRISPR Screening
    • CRISPR-Cas9 Target Essentiality Screening

OncoSignature

OncoSignature 正在成為許多疾病 (包括腫瘤學) 的最佳治療選擇之一。利用藥物組合,臨床醫生可以提高:

  • 先導化合物的功效或克服耐藥機制
  • 研究組合藥物反應以確定協同和拮抗相互作用
  • 比較藥物活性與批准和新興療法
  • 比較超過 800 個不同的Cell lines,以合理化您的候選藥物的患者分層決策
  • 研究小分子,抗體和抗體藥物結合物

Cell Panel Screening

除了 Screening Service 外,亦提供 Cell-based screening。包含標準細胞存活和增殖測定,可以進行共培養測定以模擬腫瘤微環境,3D 細胞培養,並檢查衰老和自噬誘導。包含的服務如下:

  • 2D / 3D Cell Proliferation Assays
  • Kinetic Imaging Assays
  • Apoptosis Assays
  • Signal Transduction Assays
  • Confocal Imaging
  • Custom In Vitro Assays